李清照在秋风秋雨中长叹的内容主要表达了她内心的 愁苦与思念。她的词作中常常流露出对逝去时光的怀念、对丈夫的思念以及对自身命运的无奈和哀伤。具体来说，她在《声声慢·寻寻觅觅》中写道：“乍暖还寒时候，最难将息。”、“三杯两盏淡酒，怎敌他、晚来风急？”、“雁过也，正伤心，却是旧时相识。”、“满地黄花堆积，憔悴损，如今有谁堪摘？”、“守着窗儿，独自怎生得黑!”、“梧桐更兼细雨，到黄昏、点点滴滴。这次第，怎一个愁字了得!”等句子，都表达了她在秋风秋雨中深深的哀愁和无尽的思念。

此外，她在《如梦令》中写道：“昨夜雨疏风骤，浓睡不消残酒。试问卷帘人，却道海棠依旧。知否？知否？应是绿肥红瘦。”这句词中的“绿肥红瘦”是指春天的绿叶繁茂和秋天的红花凋零，暗示着时光的流逝和生命的短暂，也反映了她对自己命运的无奈和哀伤。

综上所述，李清照在秋风秋雨中长叹的内容主要是对逝去时光的怀念、对丈夫的思念以及对自身命运的无奈和哀伤。