万历首辅张居正的结局是 被处决，而非被鞭尸。以下是具体经过：

政治清洗的起点

张居正去世后第四天，七名言官联合弹劾其门生潘晟，导致潘致仕被罢免。这一事件成为张居正政治生涯的转折点，标志着他彻底失去皇帝信任。

抄家与迫害

随后，言官们将矛头指向张居正，万历帝下令抄家，追缴其官职、诰命及财产，并在舆论压力下暂停迫害。张居正的家族遭大规模清洗，多人被削职或流放，其弟张居实也被处决。

结局的复杂性

直接结局：

张居正于1582年6月20日去世后，其遗体被以“大礼安葬”，未遭剖棺鞭尸。 - 历史评价：其改革措施（如考成法、一条鞭法）对明朝延续了约60年，但因其权力过大引发朝野矛盾，最终成为改革与专权矛盾的牺牲品。

总结：张居正的结局是明朝政治斗争与改革压力共同作用的结果，虽无暴虐手段，但改革引发的权力斗争仍导致其悲剧性下场。