宁化府与上水井醋的区别主要体现在以下几个方面：

颜色

宁化府的颜色是深黑色。

上水井的颜色稍浅一些。

味道

宁化府的味道比较绵甜醇香。

上水井的酸味更浓郁。

制作工艺

宁化府是酿造醋，生产过程中使用了机器。

上水井是纯手工醋，通过手工酿制而成。

品牌归属

宁化府和上水井同属于“益源庆”品牌，是益源庆旗下的两大系列醋品。

建议

选择依据：

如果偏好深黑色且味道绵甜醇香的醋，宁化府可能是更好的选择。

如果喜欢酸味浓郁且追求手工制作的醋，上水井则更为合适。

根据以上信息，可以结合个人口味偏好和具体需求来选择适合的醋品。