《亲爱的阿基米德》三部曲中的男主角关系如下：

《亲爱的阿基米德》：

主角是 甄爱和言溯。他们的关系在小说中逐渐加深。

《亲爱的弗洛伊德》：

主角是 甄意和言格。他们之间有一段离奇的过去。

《亲爱的苏格拉底》：

主角是 甄暖和言焓。他们之间的关系涉及到犯罪科技实验室和刑警队长，且较为复杂。

这三部小说中，虽然每部的主线故事和角色都不同，但都围绕着“言”姓的男主角展开，且这些男主角之间似乎存在某种联系或共同之处。