鲁迅在其散文集《朝花夕拾》中的《父亲的病》一文中，表达了自己对于父亲病重期间所经历的一系列医疗事件的深刻反思和忏悔。其中，他主要忏悔的是 自己没有让父亲安静地死去，这种内心的不安和痛苦成为了他心灵上永远的负担。

鲁迅在文中详细描述了自己为父亲延医治病的经历，特别是与当时社会上一些所谓的“名医”的交往。这些医生不仅收费高昂，而且医术不精，草菅人命，给鲁迅的父亲带来了极大的痛苦和延误。鲁迅通过这些描写，表达了对这些庸医的痛恨和对封建迷信的批判。

此外，鲁迅也表达了对父亲的深深愧疚。他意识到，在父亲病重期间，自己因为忙碌和其他原因，没有给予父亲足够的关心和照顾，甚至在父亲临终时，也因为衍太太的催促而未能让父亲平静地离去。这种内心的悔恨和自责，成为了鲁迅一生难以释怀的情感。

综上所述，鲁迅在《父亲的病》中忏悔的主要是自己没有让父亲安静地死去，这种忏悔不仅是对父亲的深情缅怀，也是对封建迷信和社会不公的深刻反思。