苹果手机在收到短信时提示两次的原因可能有以下几种：

开启了“重复提醒”功能

当你在设置中的“通知”里启用了“重复提醒”功能，手机会在收到短信后重复响铃和提醒你查阅短信。

你可以在“设置”->“通知”->“信息”中找到并关闭“重复提醒”功能，这样短信就只会提醒一次。

系统或软件问题

如果上述方法无法解决问题，可能是由于系统不稳定或软件兼容性问题导致的。此时，建议备份资料和通讯录，然后恢复出厂设置。

预览短信导致重复提醒

有时候，你可能只是预览了短信，而没有实际查看它，这也会导致重复提醒。确保在查看短信后再进行任何操作。

发送方设置

某些情况下，发送方可能会故意设置重复发送短信，以确认短信是否成功送达。这种情况下，重复提醒是发送方的设置，而非手机的问题。

综上所述，最有可能导致苹果手机短信提示两次的原因是开启了“重复提醒”功能。你可以通过进入“设置”->“通知”->“信息”并关闭“重复提醒”功能来解决这个问题。如果问题仍然存在，建议检查是否有系统或软件问题，或联系苹果官方支持寻求进一步帮助。