蔡元培是中国近代著名的教育家、思想家，他提出了“以美育代宗教”的思想。蔡元培认为，美育可以陶冶人们的感情，提升审美能力，进而改造国民精神，达到一种类似于宗教的精神升华效果。他在1917年发表的《以美育代宗教说》一文中，详细阐述了这一观点，并强调文化进步的国民既要实施科学教育，也要普及美术教育。

蔡元培的“以美育代宗教”思想不仅是对当时教育改革的积极倡导，也是对传统文化精神危机的深刻反思。他认为，在物质文明迅速发展的时代，单一的宗教信仰已经无法满足人们对精神和道德的追求，而美育正好可以填补这一空缺。通过美育，人们可以通过美的体验来修身齐家治国平天下，从而实现个人和社会的和谐发展。

综上所述，提出“以美育代宗教”思想的是蔡元培。